翻译后修饰（Post-Translational Modifications, PTMs）广泛参与信号转导、蛋白质稳定性、亚细胞定位等关键生命过程，是系统生物学与疾病机制研究的核心关注点。然而，多种修饰的共存、空间结构耦合和低丰度特性使其表征异常复杂。多数蛋白质组学策略基于酶解肽段分析，虽在通量和覆盖度方面具备优势，却常因修饰丢失或位点模糊影响定性与定量精度，难以全面解析蛋白质异构体状态（proteoforms）。Top-Down质谱（Top-Down Mass Spectrometry, TD-MS）作为直接分析整蛋白的方法，在原位保留修饰信息、实现精确定点识别方面展现出明显优势，已成为蛋白质修饰研究中的关键技术选项。

一、Top-Down质谱的三大机制优势

1、保留修饰上下文，构建完整修饰图谱

Top-Down质谱直接对完整蛋白进行电喷雾离子化（ESI）与高分辨检测，可在无需酶解的前提下获取蛋白修饰全貌，尤其适用于构建修饰共存模式及蛋白功能异构体的全景图谱。对于研究不同修饰协同调控生物功能、构建单蛋白多态性网络尤为关键。

2、高精度位点定位，适配复杂修饰解析

通过引入ETD（电子转移解离）、ECD（电子俘获解离）等碎裂方式，Top-Down质谱可在最大限度保留修饰基团的同时，实现序列层面裂解。这种“保修饰解构”机制有效提升了修饰位点的识别准确性，特别适合研究磷酸化、乙酰化、泛素化等动态可逆修饰。

3、区分微小差异，识别功能异构体

Top-Down质谱具备优异的质量分辨率与谱图解卷能力，能精确区分仅在修饰类型或位置上存在差异的蛋白异构体。对于表征疾病相关蛋白修饰亚型、解析微环境调控机制等具有重要价值。

二、应用Top-Down质谱进行PTM分析的关键要素

尽管Top-Down策略在信息完整性与精度上具备优势，但其对实验操作与数据解析提出更高要求：

1、高纯度蛋白制备

Top-Down质谱对样本完整性和纯度要求极高。需采用非变性条件进行蛋白提取，并结合SEC、CZE或高分辨液相实现预分离，避免背景干扰及信号淹没。

2、平台性能与裂解模式选择

高分辨率质谱平台是解析复杂修饰模式的基础。结合ETD/ECD等温和裂解模式不仅有助于保留修饰信息，也利于实现更均匀的片段离子覆盖。

3、高级谱图解析算法

整蛋白裂解后产生的谱图通常包含大量重叠信号，需借助先进的解卷积算法与序列匹配引擎进行识别与注释，尤其在处理低丰度修饰或共存异构体时，算法性能直接影响分析深度与准确度。

三、Top-Down质谱在PTM研究中的应用前景

Top-Down质谱正推动蛋白质组学向更高层级的结构表征与功能解释演进。其在下列研究场景中展现出广阔前景：

• 功能蛋白异构体构建：揭示同源蛋白因修饰差异形成的功能状态变体；
• 疾病标志物筛选：识别修饰异构体在癌症、神经疾病等状态中的特异表达；
• 药物作用机制解析：追踪药物诱导的修饰变化对信号通路的调控效应；
• 单细胞/低量样本分析：借助高灵敏Top-Down策略解析微量样本的修饰结构。

Top-Down质谱提供了一种更具结构完整性与修饰保真度的蛋白质分析方式，为PTM表征带来技术飞跃。通过该策略，科研人员得以在单蛋白层面实现精确、系统的修饰图谱构建，推动从序列到功能的整合性认知。百泰派克生物科技提供从整蛋白制备、修饰结构鉴定到功能关联建模的全流程服务。我们致力于帮助客户解析关键修饰事件，挖掘蛋白质功能调控的分子基础。无论您的研究聚焦于信号通路重编程、疾病蛋白修饰网络，或是功能蛋白质组构建，百泰派克生物科技均可提供稳定可靠的数据支持与专业技术方案。如需获取Top-Down质谱应用建议或定制化实验方案，欢迎联系我们！

百泰派克生物科技特色项目

一、蛋白测序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos质谱仪及岛津公司埃德曼降解测序系统对蛋白质序列进行分析，提供基于质谱的蛋白测序分析服务，包括对蛋白质的氨基酸组成分析，N端测序，C端测序和全序列分析，以及基于埃德曼降解的蛋白质N端序列分析服务。对于未知理论序列的蛋白质，提供基于从头测序法的蛋白质从头测序服务，对蛋白序列进行分析。

※服务优势：

1.采用目前世界上先进的质谱仪器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可实现对所测定靶蛋白序列 100% 的覆盖;

3.可测定蛋白N端多达 70个氨基酸序列;

4.可测定多种形式的样品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白条带;

5.样品用量低: 蛋白样品仅需 5-10ug，即可完成检测;

6.测序不受N端封闭，PEC和和糖基化等N端修饰的影响。

二、蛋白质组学

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合Nano-LC，提供定量蛋白质组学、靶向蛋白质组学、多肽组学、翻译后修饰蛋白组学等多种蛋白质组学分析服务。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4D蛋白质组学服务，助力微量样本蛋白组学、大样本群医学及高通量修饰组学等研究工作。

※服务优势：

1 .高通量定量蛋白分析:多对照组大规模实验分析，发现新的生物标记物;

2.体内体外多种蛋白质标记方法，适用于分析组织、细胞、血液等多种样品;

3.质谱分析灵敏度高，实验结果重复度高;

4.可检测较低丰度蛋白，线性范围广;

5.专业生物信息学分析，分析更系统准确。

三、单细胞质谱流式技术分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm质谱流式系统进行单细胞质谱流式技术分析，采用金属元素标记物（通常是金属元素标记的特异抗体）标记细胞表面和内部的分子，然后用流式细胞原理分离单个细胞，再用电感耦合等离子体质谱（ICP-MS）分析单个细胞的原子质量谱，最后将原子质量谱数据转换为细胞表面和内部的信号分子表达量。

※服务优势：

1.技术先进，填补技术空白

采用金属标记抗体技术，避免了传统流式荧光通道少且易相互影响的问题。可在单细胞层面上对多种指标同时进行表征，百泰派克生物科技可做到同时检测51个目标蛋白。

2.分析数量大，成本较低

单细胞RNAseq受成本等因素限制，所有样本细胞汇总的分析数目一般在2x10^4个左右，而流式质谱技术一次（单样本）就可分析至少10^5的细胞，实现了数量级的提高，且成本不高于单细胞RNAseq。

3.应用前景大

①流式质谱结果可以给出细胞亚群的变化，在临床诊断、疾病机制研究等方面具有极大的研究前景；

②将金属标签技术与其他技术结合会有新应用方向。除常规蛋白外，质谱流式细胞技术还可用于蛋白翻译后修饰；

③可检测细胞存活率、细胞大小、mRNA转录子表达量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。

四、基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现

百泰派克生物科技的基于高精度质谱的免疫多肽组学分析及新抗原发现一站式解决方案包括我们专有的、高度敏感的免疫肽富集和鉴定方案。我们能够帮助您实现10,000个以上I型多肽和10,000个以上II型多肽的鉴定和识别。通过我们优化的高通量免疫多肽组学分析平台进行免疫肽组学分析，可从最小的样品材料中进行可重复的识别和定量。该服务可以应用于大规模的研究，旨在助力科研工作者寻找癌症、免疫疾病及传染病的解决方案，深入挖掘未知的靶标。

五、生物药物表征

百泰派克基于高分辨率质谱技术，MALDI TOF，高效色谱分离技术，提供一系列完善的生物药物分析方案，从蛋白质、多肽、抗体、疫苗等生物制品的氨基酸组成和一级结构分析，到产品变异性和纯度分析。旨在提供优质生物药物分析服务，帮助生物医药生产商提高生物药物品质。

百泰派克生物科技七大检测平台

百泰派克生物科技-生物制品表征，生物质谱多组学优质服务商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于为生物/制药和医疗器械行业提供质量控制检测和项目验证等专业服务。公司实验室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法规和指导原则，通过CNAS/ISO9001双重质量体系认证，建立了完备的质量体系，数据冷热/异地备份，设备定期计量/期间核查，软件审计追踪，为客户提供一体化解决方案和技术服务，支持新药研发、药物申报注册和生产放行。

1.公司采用ISO9001质量控制体系，专业提供以质谱为基础的CRO检测分析服务；

2.获国家CNAS实验室认可，为客户提供符合全球药政法规的药物质量研究服务；

3.业务范围覆盖蛋白质组学、多肽组学、代谢组学、生物药物表征、单细胞分析、单细胞质谱流式、生信云分析以及多组学生物质谱整合分析等；

4.七大质量控制检测平台，满足您一站式服务需求；

5.服务3000+企业，10000+客户的选择；

6.致力于为您提供优质的生物质谱分析服务!

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